miércoles, 7 de septiembre de 2011

Zisupton , una nueva superfamilia de elementos transposable de DNA recientemente actives en peces

Foto bajada de aquí


Los elementos transponibles son amplias secuencias de DNA móviles capaces de integrarse en nuevos lugares dentro de los genomas. A través de la transposición y recombinación, contribuyen de manera importante a la plasticidad del genoma y la evolución. También pueden regular la expresión génica y proporcionar secuencias reguladoras y la codificación para la evolución de las funciones de genes nuevos. Se ha identificado una nueva superfamilia de ADN transposón en el cromosoma Y de los Xiphophorus maculatus platyfish. Este elemento es de 11 kb de longitud y lleva a una única secuencia de codificación de 24 exones. La parte N-terminal de la proteína putativo, que se expresa en todos los tejidos adultos probado, contiene ácidos nucleicos y varios dominios de unión a proteínas y puede corresponder a un nuevo tipo de transposasa / integrasa no descrito hasta ahora en ningun transposón. Además, una isoforma de empalme específica del testículo codifica un dominio de la proteasa C-terminal Ulp1 SUMO, lo que sugiere una función en la modificación de proteínas después de la traducción mediada por SUMO y / o pequeños péptidos de ubiquitina. En consecuencia, este elemento fue llamado Zisupton, por Zinc finger SUMO protease transposon. Al lado de la secuencia del cromosoma Y, cinco copias de otros muy similares copias fueron identificados en el genoma de platyfish. Todas las copias están delimitados por 99 pb conservada repeticiones invertidas subterminal y flanqueado por duplicaciones de sitios blancos de 8 nt de copias específicas reflejando su integración en diferentes posiciones en el genoma. Elementos Zisupton se insertan en diferentes localizaciones genómicas de diferentes especies de poecílido sino también en diferentes poblaciones de X. maculatus. Tales polimorfismos de inserción entre especies relacionadas y de las poblaciones indican la actividad de transposición relativamente reciente, con un alto grado de identidad de nucleótidos entre las especies que sugiere la posible implicación de la transferencia horizontal de genes. Secuencias Zisupton fueron detectados en otras especies de peces, en urochordates, cephalochordates y hemichordates, así como en los organismos más distantes como los hongos basidiomicetos, hongos, algas pardas y las algas verdes filamentosas. Ejemplos posibles de genes nucleares derivados de Zisupton han sido identificados. Para concluir,los análisis han descubierto una nueva superfamilia de ADN transposón con potenciales roles en la diversidad del genoma y la innovación evolutiva en los peces y otros organismos.

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