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Un mapa de ligamiento genético es una poderosa herramienta de investigación para el mapeo de los rasgos de interés y es esencial para entender la evolución del genoma. El objetivo de este estudio es proporcionar un mapa ampliado de ligamiento genético de la carpa común para llevar a cabo eficazmente el análisis de rasgos cuantitativos loci y realizar análisis de mapeo comparativo entre linajes. Aquí se construyó un mapa de ligamiento genético de la carpa común (Cyprinus carpio L.) con el polimorfismo de microsatélites y Marcadores de un solo nucleótido (SNP en una familia de159 hermanos
Un total de 246 microsatélites y 306 marcadores polimórficos SNP fueron genotipados en esta familia. Análisis de ligamiento utilizando JoinMap 4,0 organizó 427 marcadores (186 microsatélites y 241 SNP) a 50 grupos de ligamiento, que varían en tamaño desde 1,4 hasta 130,1 cM.
Cada grupo contenía 2-30 marcadores. El mapa de ligamiento genético cubrió una distancia de 2,039.2 cM y el intervalo promedio de marcadores dentro de los grupos de ligamiento fue de aproximadamente 6,4 cm. Además, el análisis comparativo del genoma dentro de los cinco modelo de peces teleósteos reveló un alto porcentaje (74,7%) de los loci conservados correspondientes a los cromosomas del pez cebra. En la mayoría de los casos, cada cromosoma de pez cebra consta de dos grupos de ligamiento común a carpa. El análisis comparativo reveló también reordenamientos cromosómicos independientes en la carpa común y el pez cebra. El mapa de ligamiento será de gran ayuda en el mapeamiento de genes de interés y servir de referencia para abordar el mapeamiento comparativo y permiten conocer mejor la amplia investigación sobre la evolución del genoma de la carpa común.
Un total de 246 microsatélites y 306 marcadores polimórficos SNP fueron genotipados en esta familia. Análisis de ligamiento utilizando JoinMap 4,0 organizó 427 marcadores (186 microsatélites y 241 SNP) a 50 grupos de ligamiento, que varían en tamaño desde 1,4 hasta 130,1 cM.
Cada grupo contenía 2-30 marcadores. El mapa de ligamiento genético cubrió una distancia de 2,039.2 cM y el intervalo promedio de marcadores dentro de los grupos de ligamiento fue de aproximadamente 6,4 cm. Además, el análisis comparativo del genoma dentro de los cinco modelo de peces teleósteos reveló un alto porcentaje (74,7%) de los loci conservados correspondientes a los cromosomas del pez cebra. En la mayoría de los casos, cada cromosoma de pez cebra consta de dos grupos de ligamiento común a carpa. El análisis comparativo reveló también reordenamientos cromosómicos independientes en la carpa común y el pez cebra. El mapa de ligamiento será de gran ayuda en el mapeamiento de genes de interés y servir de referencia para abordar el mapeamiento comparativo y permiten conocer mejor la amplia investigación sobre la evolución del genoma de la carpa común.
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