miércoles, 23 de marzo de 2011

Genes del Complejo mayor de histocompatibilidad de clase II A y II B de halibut manchado Verasper variegatus: estructura genómica, polimorfismo molecu


Foto bajasa de aquí
El complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) es una gran región genómica caracteriza por el polimorfismo extremadamente alta y su asociación con la resistencia / susceptibilidad a enfermedades en los vertebrados. En este estudio, la longitud total de cDNA de MHC II A y II B se obtuvieron de halibut manchado (variegates Verasper) por etiquetas de secuencias expresadas (EST) y por el enfoque de la amplificación rápida de extremos de cDNA (RACE). La estructura genómica, el polimorfismo molecular y los patrones de expresión fueron examinados para estudiar las funciones de los genes MHC II en los peces. Al igual que en otros teleósteos, la estructura genómica de MHC II de halibut manchado c contenía 4 exones e 3 intrones La secuencia deducida de aminoácidos de la molécula de clase II A comparte el 28-79% de similitud con los de los teleósteos y los mamíferos.Nueve alelos de clase IIA se identificaron de cinco individuos. Tres alelos provenientes de un solo individuo sugiere la existencia de al menos dos loci de clase IIA en el genoma. Seis exones y 5 intrones fueron identificados de MHC IIA desde habibut manchado, y la secuencia de aminoácidos deducida comparte, 33-79% de similitud con los teleósteos y los mamíferos. Doce alelos fueron identificados, entre los cuales cinco fueron observadas en un solo individuo, lo que sugiere al menos tres clase de loci IIB. Análisis de PCR cuantitativo en tiempo real, reveló la presencia de la clase II A y II B de transcripciones en nueve tejidos normales con alto nivel de expresión en el riñón y branquias. Por otra parte, MHC II A y II B son probablemente dos candidatos de moléculas inmunes involucrados en la respuesta de fase aguda en el halibut manchado, porque sus niveles de transcripción fueron significativamente altamente reguladas en la sangre y el hígado después del desafío bacteriano.

viernes, 18 de marzo de 2011

Pez cebra expuesto a frío disminuye su regulación en la pigmentación.

Foto bajada de aquí

Los vertebrados utilizan mecanismos adaptativos cuando se exponen a stress fisiológico. Sin embrago, los mecanismos de la regulación de la pigmentación en respuesta al stress fisiológico siguen sin estar claros. Para solucionar este problema, se ha desarrollado en adultos de pez cebra un nuevo modelo de pigmentación usando la exposición a aguas frías ( pez cebra en frío).
Cuando el pez cebra fue mantenido en 17°C, la pigmentación de las rayas fue reducida comparada con el pez cebra mantenido a 26.5°C (pez cebra normal). En los peces cebras mantenidos en frio, los niveles de expresión génica de tirosinasa y dopacromo tautomerasa, la cual codifica para las enzimas involucradas en la melanogénesis, fueron disminuidas su regulación, sugiriendo que su disminución en la regulación de la síntesis de melanina ocurrió ó disminuyó el número de melanóforos.

Observación al microscopio ordinario y electrónico de la piel de pez cebra mostró que el número de melanóforos disminuyó, mientras que la agregación de los melanosomas no fue modificada en el pez cebra mantenidos en frío en comparación con el pez cebra mantenidos en condiciones normales. En su conjunto, aquí se muestra que los adultos de pez cebra expuestos a frío disminuyen su regulación en la pigmentación a través de la disminución del número de melanóforos y propone que el modelo de pez cebra mantenido en frío es una poderosa herramienta para la investigación de la pigmentación
.

miércoles, 16 de marzo de 2011

Receptores acoplados a protein G en el pez globo Takifugu rubripes


Foto Bajada de aquí

Receptores acoplados a protein guanine (GPCRs) constituyen una familia de proteínas de transmenbrana de eucariotas y funcionan como “ interruptores moleculares” en la cascada de segundos mensajeros y se encuentran en todos los organismos entre levaduras y humanos. Ellos forman una única y mayor familia de blancos de drogas debido a su versatilidad de acción y su rol en varias funciones fisiológicas, siendo jugadores activos en la detección de la presencia de la luz, una variedad de olores y sabores, etc., aminoácidos, nucleótidos, lípidos, sustancias químicas en el medioambiente de la célula.
Estudios genómicos comparativos en organismos modelos proporcionan información sobre los receptores blancos en seres humanos y su función. El teleósteo Fugu japonés ha sido identificado como uno de los genomas más pequeños en vertebradosc y como un modelo compacto para estudiar el genoma humano, debido a la gran similitud en su repertorio de genes con el humano y otros vertebrados. Así, la caracterización de los GPCRs de Fugu podría proveer ideas a la evolución del genoma de vertebrados.
Se clasifico los GPCRs en el genoma del Fugu y los análisis de sus 316 receptores de unión a membranas, disponibles en la base de datos públicas, así como de la literatura, se detecto 298 GPCRs que fueron agrupados en cinco grandes familias de acuerdo con el sistema de clasificación GRAFS ( llamado, Glutamato, Rhodopsina, Adhesina, Frizzled y Secretina) También se identifico otros 18 GPCRs que no pudieron ser agrupados bajo la familia GRAFS y fueron clasificados como “ Otros receptores 7TM”. En las Comparaciones de la información de GPCR del genoma del Fugu con los del humano y del pollo, se detecto 96.83% (306/316) y 96.51% (305/316) de ortólogos en GPCRs entre genomas de Fugu-Humano y genomas Fugu-pollo, respectivamente.Fugu puede actuar como un modelo de referencia para el genoma humano de las familias de proteínas y otros, pasando por la alta orthologia observada para GPCRs entre Fugu y humanos. La comparación de la evolución de las secuencias de GPCR entre las principales clases de vertebrados de mamíferos, aves y pescado podría ayudar en la identificación de los residuos clave funcionales y motivos así como, llenar los espacios en blanco en la evolución de GPCRs en los vertebrados

domingo, 6 de marzo de 2011

Clonamiento molecular y caracterización de Foxp3 en salmón del Atlántico (Salmo salar)


Foto bajada de

Foxp3 es un factor de transcripción específico de células T y desempeña un papel clave en el desarrollo de las células Treg y en el proceso de regulación inmune durante la inflamación. Se muestra la clonación y caracterización del ADNc de longitud completa de Foxp3 del salmón Atlántico, que posee un dominio de cabeza de horquilla , un dominio de dedos de zinc y un dominio de cremallera de leucina-como su contraparte en los mamíferos. Foxp3 es altamente expresado en el timo. Además, la expresión regulada se observó en células de riñón de la cabeza en respuesta a β-glucano y mitógenos (LPS y ConA), y en la cabeza del riñón, el bazo y el hígado después de la inyección intraperitoneal de Aeromonas salmonicida vivas. Además, la transfección de células CHSE-214 con Foxp3 de salmón fusionado con una etiqueta de RPF de C-termial, dieron lugar a la expresión del transgén en y cerca de los núcleos durante la estimulación. En conjunto, estos resultados sugieren la presencia de un gen Foxp3 en el salmón del Atlántico que puede ser un importante factor de transcripción en la regulación inmune, investigaciones adicionales puede revelar la existencia de las células T como Treg en esta especie.