Proyecto Genómico de Medaka

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Durante la última década, la mayoría de organismos modelo, como ratones y humanos, han tenido sus genomas completamente secuenciados. Medaka (Oryzias latipes) es uno de los vertebrados del modelo que ha generado interés creciente en la genética del desarrollo, la genómica y la biología evolutiva y se ha convertido también en un sistema de prueba importante en estudios de ecotoxicología y carcinogénesis. En particular, la primera demostración de herencia ligado al cromosoma Y en una especie. La primera exitosa inversión del sexo en vertebrados y la identificación del gen que determina el macho, DMY, el equivalente a primer SRY. no-mamífero.
Se obtuvieron 648 Mb de secuencia genómica de otra cepa endogámica HNI. Hd-RR y HNI pertenecen a diferentes poblaciones aisladas de medaka en las zonas sur y norte, respectivamente, de Japón, y por lo tanto un alto grado de polimorfismo se espero. La alineación de estos dos genomas de medaka identifico alrededor de 16,4 millones de polimorfismos de nucleótido único (SNP), de los cuales 2.401 SNPs fueron asignadas genéticamente en cromosomas de medaka utilizando un panel de cruce entre HD-RR y HNI.

La inducción de la transcripción de c-fos en el cerebro de medaka (Oryzias latipes) en respuesta a los estímulos de apareamiento.

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Genes tempranos inmediatos, (IEGs) son útiles para el mapeo de las regiones activas del cerebro en diferente vertebrados. Aquí hemos identificado un gen homólogo de c-fos en medaka y se demostró que las cantidades de transcripciones de c-fos y proteínas en el cerebro medaka aumento en relación con un apareamiento artificialmente evocados, lo que sugiere que el gen homólogo tiene las características de IEGs, que se utilizan como marcadores de actividad neuronal. A continuación, la reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa cuantitativa reveló que comportamientos de apareo de la hembra aumento la regulación de la trascripción c_fos en algunas regiones del cerebro incluyendo
telencéfalo, tectum óptico, y el cerebelo. Además, se realizó la hibridación in situ con una sonda del intrón c-fos para detectar la síntesis de novo de los transcriptos de c-fos y confirmó la inducción de la transcripción de c-fos en estas regiones del cerebro después del apareamiento. Este es el primer informe de la inducción de IEG en respuesta a los estímulos de apareamiento de los peces teleósteos. Nuestros resultados indican que la expresión de c-fos se induce en respuesta a los estímulos del comportamiento en el cerebro de medaka y que c-fos de Medaka podría ser un marcador útil de la actividad neuronal.

Estructura, diversidad y patrones evolutivos de la expresión de genes de MHC de clase IIB en la carpa (Squalius cephalus), una especie de peces ciprí

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El polimorfismo del exón 2 de los genes DAB (complejo principal de histocompatibilidad [MHC] Clase IIb) fue investigado por primera vez en las especies de peces de agua dulce de ciprínidos, Squalius cephalus, en la amplia gama de su distribución en Europa. Se identificaron 111 diferentes variantes de MHC de clase II B en 15 poblaciones de carpa distribuidos desde Finlandia a España. El análisis de la secuencia mostró que muchos sitios de amino ácido estructuralmente importantes se conservan entre los tetrápodos también se conserva en la carpa. El análisis de la recombinación indicó que no juega un papel importante en la producción y el mantenimiento de la variación de los genes DAB analizados en el presente estudio. El exón 2 ha demostrado ser sometido a una intensa selección positiva. El análisis filogenético, y las secuencias de identidad sugieren la presencia de dos loci de clase II B (similar a DAB1 y similar a DAB3 ) en la carpa. Sin embargo, la presencia de tres variantes de la secuencia similar a DAB3 en varios individuos indica la duplicación del gen DAB3