Un mapa de ligamiento genético y el análisis comparativo del genoma de la carpa común (Cyprinus carpio L.) usando microsatélites y SNP.

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Un mapa de ligamiento genético es una poderosa herramienta de investigación para el mapeo de los rasgos de interés y es esencial para entender la evolución del genoma. El objetivo de este estudio es proporcionar un mapa ampliado de ligamiento genético de la carpa común, llevar a cabo eficazmente el análisis de loci de rasgos cuantitativos y realizar análisis de mapeo comparativo entre linajes. Aquí se construyó un mapa de ligamiento genético de la carpa común (Cyprinus carpio L.) usando marcadores de microsatélites y polimorfismo nucleótido único ( SNP) en una familia de 159 hermanos. Un total de 246 marcadores de microsatélites y 306 SNP marcadores polimórficos fueron genotipo en esta familia. Análisis de ligamiento utilizando JoinMap 4,0 ordenado en 427 marcadores (186 microsatélites y 241 SNP) a 50 grupos de ligamiento, que varían en tamaño desde 1,4 hasta 130,1 cM. Cada grupo contiene 20-30 marcadores. El mapa de ligamiento genético cubrió una distancia de 2,039.2 cM y el intervalo promedio de marcadores dentro de los grupos de ligamiento fue de aproximadamente 6,4 cM. Además, el análisis comparativo del genoma dentro de los cinco peces teleósteos modelo reveló un alto porcentaje (74,7%) de los loci conservados correspondientes a los cromosomas del pez cebra. En la mayoría de los casos, cada cromosoma del pez cebra consta de dos grupos de ligamiento de la carpa común.El análisis comparativo reveló también reordenamientos cromosómicos independientes en la carpa común y el pez cebra. El mapa de ligamiento será de gran ayuda en la cartografía de genes de interés y servir de referencia para abordar la cartografía comparativa y permiten conocer mejor la amplia investigación sobre la evolución del genoma de la carpa común.