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Durante la última década, la mayoría de organismos modelo, como ratones y humanos, han tenido sus genomas completamente secuenciados. Medaka (Oryzias latipes) es uno de los vertebrados del modelo que ha generado interés creciente en la genética del desarrollo, la genómica y la biología evolutiva y se ha convertido también en un sistema de prueba importante en estudios de ecotoxicología y carcinogénesis. En particular, la primera demostración de herencia ligado al cromosoma Y en una especie. La primera exitosa inversión del sexo en vertebrados y la identificación del gen que determina el macho, DMY, el equivalente a primer SRY. no-mamífero.
Se obtuvieron 648 Mb de secuencia genómica de otra cepa endogámica HNI. Hd-RR y HNI pertenecen a diferentes poblaciones aisladas de medaka en las zonas sur y norte, respectivamente, de Japón, y por lo tanto un alto grado de polimorfismo se espero. La alineación de estos dos genomas de medaka identifico alrededor de 16,4 millones de polimorfismos de nucleótido único (SNP), de los cuales 2.401 SNPs fueron asignadas genéticamente en cromosomas de medaka utilizando un panel de cruce entre HD-RR y HNI.
Se obtuvieron 648 Mb de secuencia genómica de otra cepa endogámica HNI. Hd-RR y HNI pertenecen a diferentes poblaciones aisladas de medaka en las zonas sur y norte, respectivamente, de Japón, y por lo tanto un alto grado de polimorfismo se espero. La alineación de estos dos genomas de medaka identifico alrededor de 16,4 millones de polimorfismos de nucleótido único (SNP), de los cuales 2.401 SNPs fueron asignadas genéticamente en cromosomas de medaka utilizando un panel de cruce entre HD-RR y HNI.
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