jueves, 22 de septiembre de 2011

La inducción de la ginogénesis meiótica en el bacalao del Atlántico (Gadus morhua L.) a través de shock de presión.



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El bacalao del Atlántico, Gadus morhua, es una de las especies más importantes para la pesca comercial y un candidato prometedor para la acuicultura. La maduración sexual precoz de los machos es uno de los principales problemas que comprometen la producción a gran escala. Los enfoques posibles para este problema incluyen la producción de población todo hembra. En consecuencia, el objetivo de este estudio fue desarrollar un protocolo eficaz para inducir ginogénesis meiótica en el bacalao del Atlántico mediante el uso de un schock de presión hidrostática. El experimento probó por primera vez la importancia de la calidad de los gametos en el logro de la manipulación de los cromosomas e identificar el mejor intervalo de tiempo entre la fertilización y el shock de presión. El segundo experimento fue diseñado para determinar el valor de la presión óptima y la duración del shock de presión. Ocho combinaciones de valores de presión y la duración se pusieron a prueba. Entre ellos, la combinación 34.47MPa/6min dio la mejor tasa de supervivencia (23,6 ± 3,9%), el mayor porcentaje de larvas normales (15,7 ± 3,6%), y el mayor porcentaje de diploides meióticos (88,89%). En ambos experimentos, los controles de haploides sirvió como una referencia indirecta para la inactivación del ADN paterno. Conteo de cromosomas confirmó el restablecimiento de la diploidía en los peces gynogenetic. En el presente estudio se optimiza un procedimiento para la inducción de ginogénesis meiótica en el bacalao del Atlántico, sentando así la base para las aplicaciones más hacia la producción de un solo sexo y la definición del sistema de determinación del sexo


miércoles, 7 de septiembre de 2011

Zisupton , una nueva superfamilia de elementos transposable de DNA recientemente actives en peces

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Los elementos transponibles son amplias secuencias de DNA móviles capaces de integrarse en nuevos lugares dentro de los genomas. A través de la transposición y recombinación, contribuyen de manera importante a la plasticidad del genoma y la evolución. También pueden regular la expresión génica y proporcionar secuencias reguladoras y la codificación para la evolución de las funciones de genes nuevos. Se ha identificado una nueva superfamilia de ADN transposón en el cromosoma Y de los Xiphophorus maculatus platyfish. Este elemento es de 11 kb de longitud y lleva a una única secuencia de codificación de 24 exones. La parte N-terminal de la proteína putativo, que se expresa en todos los tejidos adultos probado, contiene ácidos nucleicos y varios dominios de unión a proteínas y puede corresponder a un nuevo tipo de transposasa / integrasa no descrito hasta ahora en ningun transposón. Además, una isoforma de empalme específica del testículo codifica un dominio de la proteasa C-terminal Ulp1 SUMO, lo que sugiere una función en la modificación de proteínas después de la traducción mediada por SUMO y / o pequeños péptidos de ubiquitina. En consecuencia, este elemento fue llamado Zisupton, por Zinc finger SUMO protease transposon. Al lado de la secuencia del cromosoma Y, cinco copias de otros muy similares copias fueron identificados en el genoma de platyfish. Todas las copias están delimitados por 99 pb conservada repeticiones invertidas subterminal y flanqueado por duplicaciones de sitios blancos de 8 nt de copias específicas reflejando su integración en diferentes posiciones en el genoma. Elementos Zisupton se insertan en diferentes localizaciones genómicas de diferentes especies de poecílido sino también en diferentes poblaciones de X. maculatus. Tales polimorfismos de inserción entre especies relacionadas y de las poblaciones indican la actividad de transposición relativamente reciente, con un alto grado de identidad de nucleótidos entre las especies que sugiere la posible implicación de la transferencia horizontal de genes. Secuencias Zisupton fueron detectados en otras especies de peces, en urochordates, cephalochordates y hemichordates, así como en los organismos más distantes como los hongos basidiomicetos, hongos, algas pardas y las algas verdes filamentosas. Ejemplos posibles de genes nucleares derivados de Zisupton han sido identificados. Para concluir,los análisis han descubierto una nueva superfamilia de ADN transposón con potenciales roles en la diversidad del genoma y la innovación evolutiva en los peces y otros organismos.

jueves, 1 de septiembre de 2011

Un mapa de ligamiento genético y el análisis comparativo del genoma de la carpa común (Cyprinus carpio L.) mediante microsatélites y SNPs.



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Un mapa de ligamiento genético es una poderosa herramienta de investigación para el mapeo de los rasgos de interés y es esencial para entender la evolución del genoma. El objetivo de este estudio es proporcionar un mapa ampliado de ligamiento genético de la carpa común para llevar a cabo eficazmente el análisis de rasgos cuantitativos loci y realizar análisis de mapeo comparativo entre linajes. Aquí se construyó un mapa de ligamiento genético de la carpa común (Cyprinus carpio L.) con el polimorfismo de microsatélites y Marcadores de un solo nucleótido (SNP en una familia de159 hermanos
Un total de 246 microsatélites y 306 marcadores polimórficos SNP fueron genotipados en esta familia. Análisis de ligamiento utilizando JoinMap 4,0 organizó 427 marcadores (186 microsatélites y 241 SNP) a 50 grupos de ligamiento, que varían en tamaño desde 1,4 hasta 130,1 cM.
Cada grupo contenía 2-30 marcadores. El mapa de ligamiento genético cubrió una distancia de 2,039.2 cM y el intervalo promedio de marcadores dentro de los grupos de ligamiento fue de aproximadamente 6,4 cm. Además, el análisis comparativo del genoma dentro de los cinco modelo de peces teleósteos reveló un alto porcentaje (74,7%) de los loci conservados correspondientes a los cromosomas del pez cebra. En la mayoría de los casos, cada cromosoma de pez cebra consta de dos grupos de ligamiento común a carpa. El análisis comparativo reveló también reordenamientos cromosómicos independientes en la carpa común y el pez cebra. El mapa de ligamiento será de gran ayuda en el mapeamiento de genes de interés y servir de referencia para abordar el mapeamiento comparativo y permiten conocer mejor la amplia investigación sobre la evolución del genoma de la carpa común.