la respuesta transcripcional de medaka marinos (javanicus latipes) sobre la exposición al toxafeno.

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Perfiles de expresión génica diferencial se establecieron a partir de los tejidos de la cabeza y el hígado de los peces marinos medaka (javanicus latipes) después de su exposición al toxafeno, un contaminante orgánico persistente e insecticidas, usando la visualización diferencial de la reacción en cadena de la polimerasa. Veinte y siete genes expresados diferencialmente fueron identificados, que se asociaron con el citoesqueleto, el desarrollo, el metabolismo, el ácido nucleico / proteína de unión, y la transducción de señales. Entre estos genes, los que codifican biomarcadores moleculares conocidos por estar involucrado en el metabolismo, la hidrólisis del ATP, y la regulación de proteínas fueron fuertemente inducidos a nivel de transcripción y genes que codifican para una subunidad de la proteína estructural o que participan en el metabolismo de los lípidos fueron fuertemente inhibidos. Las mismas tendencias en los cambios de expresión génica se observaron con el análisis de PCR en tiempo real de 12 clones seleccionados. Los genes identificados se podrían utilizar como biomarcadores moleculares de las respuestas biológicas a la contaminación de policlorados canfeno en los ambientes acuáticos.

Proyecto Genómico de Medaka

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Durante la última década, la mayoría de organismos modelo, como ratones y humanos, han tenido sus genomas completamente secuenciados. Medaka (Oryzias latipes) es uno de los vertebrados del modelo que ha generado interés creciente en la genética del desarrollo, la genómica y la biología evolutiva y se ha convertido también en un sistema de prueba importante en estudios de ecotoxicología y carcinogénesis. En particular, la primera demostración de herencia ligado al cromosoma Y en una especie. La primera exitosa inversión del sexo en vertebrados y la identificación del gen que determina el macho, DMY, el equivalente a primer SRY. no-mamífero.
Se obtuvieron 648 Mb de secuencia genómica de otra cepa endogámica HNI. Hd-RR y HNI pertenecen a diferentes poblaciones aisladas de medaka en las zonas sur y norte, respectivamente, de Japón, y por lo tanto un alto grado de polimorfismo se espero. La alineación de estos dos genomas de medaka identifico alrededor de 16,4 millones de polimorfismos de nucleótido único (SNP), de los cuales 2.401 SNPs fueron asignadas genéticamente en cromosomas de medaka utilizando un panel de cruce entre HD-RR y HNI.

La inducción de la transcripción de c-fos en el cerebro de medaka (Oryzias latipes) en respuesta a los estímulos de apareamiento.

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Genes tempranos inmediatos, (IEGs) son útiles para el mapeo de las regiones activas del cerebro en diferente vertebrados. Aquí hemos identificado un gen homólogo de c-fos en medaka y se demostró que las cantidades de transcripciones de c-fos y proteínas en el cerebro medaka aumento en relación con un apareamiento artificialmente evocados, lo que sugiere que el gen homólogo tiene las características de IEGs, que se utilizan como marcadores de actividad neuronal. A continuación, la reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa cuantitativa reveló que comportamientos de apareo de la hembra aumento la regulación de la trascripción c_fos en algunas regiones del cerebro incluyendo
telencéfalo, tectum óptico, y el cerebelo. Además, se realizó la hibridación in situ con una sonda del intrón c-fos para detectar la síntesis de novo de los transcriptos de c-fos y confirmó la inducción de la transcripción de c-fos en estas regiones del cerebro después del apareamiento. Este es el primer informe de la inducción de IEG en respuesta a los estímulos de apareamiento de los peces teleósteos. Nuestros resultados indican que la expresión de c-fos se induce en respuesta a los estímulos del comportamiento en el cerebro de medaka y que c-fos de Medaka podría ser un marcador útil de la actividad neuronal.

Estructura, diversidad y patrones evolutivos de la expresión de genes de MHC de clase IIB en la carpa (Squalius cephalus), una especie de peces ciprí

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El polimorfismo del exón 2 de los genes DAB (complejo principal de histocompatibilidad [MHC] Clase IIb) fue investigado por primera vez en las especies de peces de agua dulce de ciprínidos, Squalius cephalus, en la amplia gama de su distribución en Europa. Se identificaron 111 diferentes variantes de MHC de clase II B en 15 poblaciones de carpa distribuidos desde Finlandia a España. El análisis de la secuencia mostró que muchos sitios de amino ácido estructuralmente importantes se conservan entre los tetrápodos también se conserva en la carpa. El análisis de la recombinación indicó que no juega un papel importante en la producción y el mantenimiento de la variación de los genes DAB analizados en el presente estudio. El exón 2 ha demostrado ser sometido a una intensa selección positiva. El análisis filogenético, y las secuencias de identidad sugieren la presencia de dos loci de clase II B (similar a DAB1 y similar a DAB3 ) en la carpa. Sin embargo, la presencia de tres variantes de la secuencia similar a DAB3 en varios individuos indica la duplicación del gen DAB3

Molecular clonamiento, caracterización y análisis de expresión de los genes TLR9, MyD88 y TRAF6 en carpa común ( Cyprinus carpio

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Inducción de vías inmune innatas es crítica para la defensa temprana del huésped, pero es limitado el entendimiento de cómo los peces teleósteos reconocen moléculas patógenas y activan esas vías. En mamíferos, las células del sistema inmune innato detecta estructuras moleculares patogénicas usando patrones de receptores de reconocimiento (PRRs). Funciones de TLR9 como un PRR que reconoce motivos CpG en DNA bacteriano y viral y MyD88 y TRAF6 requiere moléculas adaptadora para la señal de transducción. Aquí se reporta el aislamiento de la longitud total del cDNA, caracterización estructura y análisis de expresión de mRNA en tejidos de los genes ortólogos TLR9, MyD88 y TRAF6 en la carpa común. El marco de lectura abierto predice una codificada proteína de 1,064 amino acidos. Se encontró que los genes MyD88 y TRAF6 están duplicados en la carpa común. Ensayos de PCR cuantitativo de tiempo Real de los genes TLR9, MyD88a y b, y TRAF6ay b trascriptos de la carpa común indican que la expresión de mRNA varia entre tejidos. Expresión diferencial de copias duplicadas fueron encontradas para MyD88 y TRAF6 en carpa común en el tejido de musculo blanco y rojo, sugiriendo que paralogos pueden haber evolucionado y alcanzado una nueva función.

Caraterización molecular y patrón de expresión de tres genes de la zona pelucida en esturion chino (Acipenser sinensis)

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Esturión chino (Acipenser sinensis) es una especie en peligro de extinción y también un recurso importante para la industria de la acuicultura. cDNA de longitud completa de tres genes de la glicoproteína de la zona pelucida fueron clonados y secuenciados. Los nuevos genes fueron denominados AsZP3.1, AsZP3.2, and AsZP3.3. Presentaron 1,388 pares de base (bp), 1,288 y 1,290 bp en longitud respectivamente y que podría traducirse en proteínas con 440, 394, y 398 aminoácidos, respectivamente.

Análisis de RT-PCR indicaron que AsZP3.1 mostraron una amplia distribución tisular en los niveles de mRNA incluyendo el hígado, riñón, bazo, corazón, y el ovario, pero ARNm de AsZP3.2 AsZP3.3 se expresa exclusivamente en la gónada.
Los tres mRNAs de AsZP3 no se detectaron durante la embriogénesis y el desarrollo larval y, además, no se detectaron en las gónadas de 1 y 2 años de edad en los esturiones chinos. Los tres mRNAs de AsZP3 se detectaron en los testículos de los machos de 3 años de edad y en los ovarios, de 4 y 5 años de edad, los esturiones chinos de hembra.

Trucha arcoiris posee dos mRNA de hormona sensible a lipase que se expresan diferencialmente y son reguladas independientemente por el estado nutricio

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Peces teleósteos almacenan lípidos en varios tejidos como triacilglicerol (TG). Durante la demanda metabólica, TGs almacenados son hidrolizados por la hormona sensible a lipasa (HSL). En este estudio, fueron aislados dos distintos cDNA que codifican HSL, clonadas y secuenciadas desde tejido adiposo en trucha arcoíris. La longitud total de los cDNAs, designadas como HSL1 y HSL2, fue de 2562 y 2887 pares de base en longitud respectivamente y comparten un 82% de identidad nucleotídica.
Análisis filogenético sugiere que las dos HSLs derivan de genes parálogos que pueden haber surgido durante un evento de duplicación específica del genoma de teleósteos. PCR cuantitativa en tiempo real, reveló que el HSL1 y HSL2 son expresados diferencialmente, tanto en términos de distribución entre los tejidos, así como en términos de abundancia en los tejidos seleccionados juveniles de trucha.