viernes, 8 de octubre de 2010

Caraterización de secuencias y análisis filogenético de 5S ADN ribosomal en las especies de la familia Batrachoididae

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Secuencias de 5S ADN ribosomal (ADNr) fueron analizadas en cuatro especies pertenecientes a géneros diferentes de la familia de los peces Batrachoididae. Varias variantes de 5S ADNr en sus diferentes espaciadores no transcritos (NTSs) se encontraron y fueron agrupados en dos tipos principales. Dos especies mostraron dos tipos de 5S ADNr, mientras que las otras dos especies mostraron un solo tipo. Un tipo de NTS de Amphichthys cryptocentrus mostró un polimorfismo elevado debido a varia deleciones e inserciones, y el análisis filogenético mostro agrupaciones entre-especies de este tipo de NTS en Amphichthys cryptocentrus. Estos resultados sugieren una clara diferenciación en el modelo de la evolución 5S ADNr de estas cuatro especies de Batrachoididae, que parecen haber sido objeto de procesos de evolución concertada.

lunes, 27 de septiembre de 2010

El cortisol está involucrado en la determinación del sexo dependiente de la temperatura en el lenguado japonés.


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En los vertebrados, el sexo se determina normalmente por el genotipo. Sin embargo, en los vertebrados poiquilotermos, incluyendo reptiles, anfibios y peces, la determinación del sexo está muy influenciado por factores ambientales, tales como la temperatura. El lenguado japones (Paralichthys olivaceus) es un pez teleósteo con un sistema de determinación de sexo XX / XY.

Sin embargo, el lenguado XX puede ser inducido a convertirse predominantemente, ya sea a hembras o machos fenotipicamente, por cría a 18 o 27 °C, respectivamente. Investigadores, han demostrado que el cortisol provoca el cambio de sexo de hembra a macho por la supresión directamente de la expresión del ARNm de cyp19a1 a través de la interferencia con la activación mediada por el AMPc y que metirapona (un inhibidor de la síntesis de cortisol) inhibe a 27 °C la inducida masculinización del lenguado XX. Por otra parte, las concentraciones de cortisol en juveniles críados a 27°C fueron significativamente mayores que los peces críados a 18° durante la diferenciación sexual. Estos resultados sugieren fuertemente que la masculinización por alta temperatura del agua es atribuible a la elevación de la concentración de cortisol durante la diferenciación del sexo gonadal en el lenguado.

viernes, 24 de septiembre de 2010

Clonamiento molecular, análisis de expresión y caracterización del gen adenilosuccinato liasa de carpa hervibora(Ctenopharyngodon idella)


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Adenilosuccinato liasa (ADSL) es una enzima bifuncional que actúan en la síntesis de novo de purinas y el reciclado de nucleótidos de purina. Investigadores construyeron una biblioteca de cDNA de instetino de la carpa hervibora (Ctenophryngodon idella). La secuencia completa del cDNA, contiene un marco abierto de lectura de 1.446 pb codificando 482 aminoácidos.La secuencia de aminoacidos deducida comparte una lata homología con su contraparte de vertebrados, comparte 94% de similitud con el pez cebra, el 81% con rana africana, así como el pollo, el 77% con humanos y el 76% con el ratón. Esta secuencia genómica ADSL de carpa hervibora esta formado por 13 exones y 12 intrones y presenta 8.557 bp. Análisis cuantitativo de PCR en tiempo real reveló que la expresión más alta de nivel de ADSL de carpa hervibora se detectó en el músculo y la menor cantidad en agalla.

miércoles, 1 de septiembre de 2010

Mapeo cromosómico de elementos retrotansposable Rex1 y Rex3 en tres species de peces de la subfamilia Hypoptopomatinae (Teleostei, Siluriformes, Lori


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Los transposones y retrotransposones representan una gran porción del genoma eucariota. Estos elementos que se repiten se pueden definir como entidades genéticas capaces de auto-inserción en posiciones diferentes dentro del genoma modificando las funciones de los genes con los que están asociados. Investigadores aislaron, identificaron y mapearon las secuencias de elementos transponibles Rex1 y Rex3 presentes en los genomas de los peces de la familia Loricariidae. En todas las especies analizadas fue posible aislar secuencias parciales de Rex1 de 520 a 563 pb y secuencias parciales de Rex3 de 407 a 454 bp. En los experimentos de hibridación in situ realizado en 3 especies , Hisonotus leucofrenatus, Pseudotocinclus tietensis, and Parotocinclus maculicauda reveló que Rex1y Rex3 comparten similares patrón de dispersión y ambos se encuentran en todos los cromosomas de la 3 especies organizados en grupos pequeños y dispersos en todos los cromosomas, incluidas las regiones eucromática y heterocromáticas, aunque una mayor concentración fue observada en las regiones heterocromáticas de H. leucofrenatus. Los datos encontrados por los investigadores contradicen la mayor parte de la literatura que confirman que los elementos retrotranspones son preferentemente acumulado en las regiones de heterocromatina en los peces.

viernes, 13 de agosto de 2010

La especiación de peces ciprínidos poliploides, de la carpa común, carpín, carpa plateada derivados de genes Hox duplicados.


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Estudios recientes en la genómica comparativa han sugerido que una ronda de duplicación del genoma entero (3R) especifico en peces con aletas radiadas podría haber ocurrido alrededor de 226-316 Mya. La duplicación del genoma adicionales, específicamente en ciprínidos, puede haber ocurrido más recientemente, después de la divergencia de los teleósteos.
El calendario de este evento, sin embargo, se desconoce. Para abordar esta cuestión, investigadores secuenciaron los genes Hox de taxones representantes de la poliploidía de peces ciprínidos, la carpa común (Cyprinus carpio, 2n = 100), carpín (Carassius auratus auratus, 2n = 100) y carpín plata (C. auratus gibelio , 2n = 156), y luego las compararon con secuencias conocidas de la diploide peces ciprínidos, dorada hocico romo (amblycephala Megalobrama, 2n = 48).
Los resultados muestran la presencia de dos distintas Hox duplicados en los genomas de la carpa común y carpín. Tres distintas secuencias Hox, una de ellas a un ortólogos de los genes Hox en la carpa común y los otros dos homólogos de un gen Hox en carpín carpa, fueron aislados en carpín plata, lo que indica un posible origen híbrido de carpín plata de carpín y carpa común . La duplicación de genes que resulta en el origen del ancestro común de la carpa común y carpín probablemente que se produjo alrededor de 10.9-13.2 Mya.

martes, 10 de agosto de 2010

La diversificación funcional y evolución de las proteínas anticongelantes del pez Antártico ( Lycodichthys dearborni)


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Investigadores combinaron técnicas moleculares y proteómicas para entender la evolución molecular y la diversidad de las proteínas anticongelante Tipo III, en un solo pez Antártico (Lycodichthys dearborni). Ellos encontraron que el screening de las etiquetas de secuencias expresadas (EST) reveló que al menos siete variantes diferentes de proteínas anticongelantes (AFP) son transcritas , que son en última instancia traducida a cinco isoformas de proteinas diferentes.

lunes, 5 de julio de 2010

Polimorfismo del Complejo Mayor de Histocompatibilidad II y su asociación con resistencia/suceptibilidad a Vibrio anguillarum en lenguado japones

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En teleósteos, poco ha sido documentada la asociación entre polimorfismo del gen del Complejo Mayor de Histocompatibilidad II (MHC) y resitencia a enfermedades .
Resistencia contra V. anguillarum fue significativamente asociado con tres alelos, Paol-DAA*1301, Paol-DAA*1401 and Paol-DAA*2201. Aumento de la suceptibilidad a V. anguillarum fue significativamente asociado con alelos Paol-DAA*1001 y Paol-DAA*1501. Este estudio confirma la asociación entre alelos del gen MHC clase alfa II y resitencia a enfermedad o suceptibilidad a infección bacterial en lenguado japonés, y los marcadores de MHC relacionados a resitencia podrían ser usados para Asistencia por marcadores moleculares en selectivos cruzaminetos de lenguado.