Mapeo cromosómico de elementos retrotansposable Rex1 y Rex3 en tres species de peces de la subfamilia Hypoptopomatinae (Teleostei, Siluriformes, Lori

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Los transposones y retrotransposones representan una gran porción del genoma eucariota. Estos elementos que se repiten se pueden definir como entidades genéticas capaces de auto-inserción en posiciones diferentes dentro del genoma modificando las funciones de los genes con los que están asociados. Investigadores aislaron, identificaron y mapearon las secuencias de elementos transponibles Rex1 y Rex3 presentes en los genomas de los peces de la familia Loricariidae. En todas las especies analizadas fue posible aislar secuencias parciales de Rex1 de 520 a 563 pb y secuencias parciales de Rex3 de 407 a 454 bp. En los experimentos de hibridación in situ realizado en 3 especies , Hisonotus leucofrenatus, Pseudotocinclus tietensis, and Parotocinclus maculicauda reveló que Rex1y Rex3 comparten similares patrón de dispersión y ambos se encuentran en todos los cromosomas de la 3 especies organizados en grupos pequeños y dispersos en todos los cromosomas, incluidas las regiones eucromática y heterocromáticas, aunque una mayor concentración fue observada en las regiones heterocromáticas de H. leucofrenatus. Los datos encontrados por los investigadores contradicen la mayor parte de la literatura que confirman que los elementos retrotranspones son preferentemente acumulado en las regiones de heterocromatina en los peces.

La especiación de peces ciprínidos poliploides, de la carpa común, carpín, carpa plateada derivados de genes Hox duplicados.

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Estudios recientes en la genómica comparativa han sugerido que una ronda de duplicación del genoma entero (3R) especifico en peces con aletas radiadas podría haber ocurrido alrededor de 226-316 Mya. La duplicación del genoma adicionales, específicamente en ciprínidos, puede haber ocurrido más recientemente, después de la divergencia de los teleósteos.
El calendario de este evento, sin embargo, se desconoce. Para abordar esta cuestión, investigadores secuenciaron los genes Hox de taxones representantes de la poliploidía de peces ciprínidos, la carpa común (Cyprinus carpio, 2n = 100), carpín (Carassius auratus auratus, 2n = 100) y carpín plata (C. auratus gibelio , 2n = 156), y luego las compararon con secuencias conocidas de la diploide peces ciprínidos, dorada hocico romo (amblycephala Megalobrama, 2n = 48).
Los resultados muestran la presencia de dos distintas Hox duplicados en los genomas de la carpa común y carpín. Tres distintas secuencias Hox, una de ellas a un ortólogos de los genes Hox en la carpa común y los otros dos homólogos de un gen Hox en carpín carpa, fueron aislados en carpín plata, lo que indica un posible origen híbrido de carpín plata de carpín y carpa común . La duplicación de genes que resulta en el origen del ancestro común de la carpa común y carpín probablemente que se produjo alrededor de 10.9-13.2 Mya.

La diversificación funcional y evolución de las proteínas anticongelantes del pez Antártico ( Lycodichthys dearborni)

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Investigadores combinaron técnicas moleculares y proteómicas para entender la evolución molecular y la diversidad de las proteínas anticongelante Tipo III, en un solo pez Antártico (Lycodichthys dearborni). Ellos encontraron que el screening de las etiquetas de secuencias expresadas (EST) reveló que al menos siete variantes diferentes de proteínas anticongelantes (AFP) son transcritas , que son en última instancia traducida a cinco isoformas de proteinas diferentes.

Polimorfismo del Complejo Mayor de Histocompatibilidad II y su asociación con resistencia/suceptibilidad a Vibrio anguillarum en lenguado japones

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En teleósteos, poco ha sido documentada la asociación entre polimorfismo del gen del Complejo Mayor de Histocompatibilidad II (MHC) y resitencia a enfermedades .

Resistencia contra V. anguillarum fue significativamente asociado con tres alelos, Paol-DAA*1301, Paol-DAA*1401 and Paol-DAA*2201. Aumento de la suceptibilidad a V. anguillarum fue significativamente asociado con alelos Paol-DAA*1001 y Paol-DAA*1501. Este estudio confirma la asociación entre alelos del gen MHC clase alfa II y resitencia a enfermedad o suceptibilidad a infección bacterial en lenguado japonés, y los marcadores de MHC relacionados a resitencia podrían ser usados para Asistencia por marcadores moleculares en selectivos cruzaminetos de lenguado.

Genómica comparativa identífica genes candidatos para resitencia de la anemia infecciosa en Salmo salar

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La anemia infecciosa del salmón (ISA) ha sido descrita como la fiebre aftosa de la cría del salmón.

Loci de rasgos cuantitativos (QTL) para la resistencia de la anemia infecciosa (ISA) ha sido mapeada por tres marcadores microsatelites sobre el grupo de ligamineto (LG) 8 (Cromosoma 15) en el mapa genético del Salmon Atlántico. Investigadores, sugieren que HIV-EP2/MBP-2 es un gen candidato muy fuerte asociado al QTL de la resistencia en ISAV en el salmón del Atlántico y es digno de estudio.

Contenido de ADN nuclear en Galaxias platei

Galaxias platei (Steindachner, 1898) es un pez endémico de Chile. Investigadores han determinado el contenido somático de ADN nuclear (valor 2C) de éste pez , presentando un valor 2C de 1,88+0,16 pg y su valor C es equivalente a 0,94 pg (921,2 pMb). Y es menor al valor documentado previamente para G. maculatus (C= 1,105 pg).

Eventos en la duplicación del genoma han dado lugar a una diversificación de la familia de genes CPT I en los peces

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La enzima, carnitina palmitoiltransferasa (CPT) I, es un regulador importante de la oxidación mitocondrial de ácidos grasos en los vertebrados. Numerosos eventos de duplicación del genoma a lo largo de la evolución han dado lugar a múltiples isoformas de esta enzima genéticamente y funcionalmente en peces. En trucha arcoiris , la presencia de cinco isoformas de CPT I sugieren repetir eventos de duplicación en peces óseos y salmónidos. Las cinco isoformas se expresan en la trucha a nivel de ARNm en el músculo esquelético, corazón, hígado, riñón e intestino. En general, el tejido muscular tenían niveles más altos de transcripción de la versión beta de las isoformas mientras que otros tejidos tenían niveles más altos de la alfa isoformas.